庆阳是中医鼻祖岐伯故里，这里中医药传统文化历史悠久，源远流长。庆阳市中医医院于1979年在原解放军林建二师职工医院和原庆阳地区第三人民医院的基础上正式建院。2012年被国家中医药管理局评定命名为三级甲等中医医院。现为陕西中医药大学、陇东学院岐伯医学院附属医院，宁夏医科大学、甘肃中医药大学、甘肃医学院、甘肃省卫生职业学院等多家医学院校的教学及实习医院；也是国家中医住院医师（5+3）规范化培训基地及甘肃省中医助理全科医师（3+2）规范化培训基地。近年来，医院在建设规模、人才队伍、医疗设备、专业设置以及科研、教学、中医药文化、中医药产业化开发等方面取得了长足发展。

医院占地面积50余亩，总建筑面积4.5万平方米，批复床位900张，现有职工837人，其中正式职工482人，聘用人员339人，退休返聘人员16人，专业技术人员770人，占90%，高级职称92人，博士研究生1人，硕士研究生36人。国务院津贴获得者2人，甘肃省名中医5人，庆阳市名中医5人，甘肃省领军人才1人，庆阳市领军人才5人。医院设有临床、医技和行政职能科室53个，门诊诊室26个。2020年门诊量约24万人次，住院病人22000余人次，手术病人4000余例。能开展内、外、妇、儿、骨伤、血液病、肛肠、针灸理疗、肿瘤、五官、皮肤、重症监护、血液透析、急危重症抢救等医疗及中医非药物传统保健业务。

医院中医特色突出，血液病科为国家临床重点专科、西北片区唯一一所血液病区域诊疗中心建设单位，肛肠科为国家中医药重点专科。骨伤科、脾胃病科、心脑病科、针灸推拿科、肺病科、风湿病科、康复科中医护理为省级中医药重点专科；肝胆病科、肾病科、脑病科、内分泌科为市级中医药重点专科。研究开发院内中药制剂35种，10种已被省卫健委批准在省内各级医疗机构调配使用；有中药制剂实验室、血液病研究实验室两个中医药科研二级实验室，国家名老中医药专家谢君国主任医师传承工作室。配备GE1.5T磁共振、64排CT、高端DR、数字胃肠机、三维彩超及奥林巴斯290电子胃镜、贝克曼系列检验设备等大型设备30余台件，中型医疗设备50余台件。