中国科学院大学深圳医院挂牌于2018年4月，由有60年历史的原光明新区人民医院、光明新区中心医院两个院区及45家社区健康服务中心组成。

目前占地面积约8.5万平方米，建筑面积约12.6万平方米，编制床位1600张，实际开放床位1350张。现有员工(含社康中心)3359人，其中博士后9人，博士76人，硕士406人，高级职称人员509人，深圳市海外高层次人才1人、深圳市卫健委骨干人才1人、青年医学人才1人、光明区高端型人才54人，骨干型人才96人。2021年完成门急诊379.61万人次，其中社康中心诊疗量195.31万人次。拥有总值12.49亿元的包括飞利浦Elition3.0T金梭磁共振、数字减影血管造影系统（DSA）、1.5T核磁共振成像系统（MRI）、128排双源螺旋CT在内的先进医疗设备约1.9万台（套）。

医院致力打造特色学科团队，学科设置齐全，临床学科38个，医技科室9个，儿科和心胸血管外科为深圳市“三名工程”学科，分别引进浙江大学医学院附属儿童医院赵正言教授儿童保健团队、四川大学华西医院赵纪春教授血管中心团队带领科室快速发展。医院获批国家胸痛中心、卒中中心建设单位、心脏康复建设单位、中国医师协会呼吸内境培训基地、广东省新生儿危重症技术工程研究中心。2021年出院病人5.04万人次，诊疗人次359万人次（其中社康196万），诊疗量居深圳市综合三级医院前五。医院近年来不断探索和优化分级诊疗改革，强化基层医疗技术服务能力，利用院办院管社康的资源整合优势，对45家社康中心实行一体化管理，不断优化双向转诊和社区慢病管理，2020年、2021年连续两年社康管理全市绩效考核取得第一名。成功创建3家国家级示范社康，3家省级示范社康，7家省级全科实践教学基地，1家区级全科技能培训中心。

医院坚持科教兴院的理念，努力构建科技创新体系和人才培养体系。拥有一个国家药物/器械临床试验基地，两个转化研究基地，包括国家高性能医疗器械创新中心临床研究与转化基地和深圳合成生物学创新研究院临床医学中心。三个科教创新平台，包括医学实验中心、转化医学研究院、中医药传承发展研究院。四个医学人才培养基地，包括广东省博士后创新实践基地、广东省教学医院、暨南大学研究生培养基地、深圳市博士后创新实践基地。医院每年承担2家临床学院的80余名“3+2”本科教学任务和300名左右的实习生。目前在站博士后5人、在读博士研究生22人，硕士研究生102人。

目前，区政府总投资近40亿元建设的新院区正在加快建设。2025年，医院将成为拥有3个院区、68个社康服务站、3000张病床的医教研一体的大型综合医疗机构。

未来，医院将立足深圳，放眼大湾区，依托中国科学院大学全国最强的师资力量及其最强的科研实力，努力探索构筑以知识创新为基础、技术创新为核心、人才培养为重点的科研教学体系，医疗与预防融合的学科发展模式，全科和专科协同发展的分级诊疗方式，坚持以人民健康为中心，秉承“厚德、精医”的院训，以学科建设为纽带，开展精准医疗，推广运用前沿医疗技术，致力于打造基本医疗保障典范，创建医教研一体高水平医院，为人民群众提供全方位、全生命周期的健康服务。