昆明市疾病预防控制中心于2002年1月23日成立，由原昆明市卫生防疫站、昆明市皮肤病防治院、昆明市结核病防治所合并组建昆明市疾病预防控制中心，同时加挂“昆明市卫生检验中心”的牌子。2017年5月5日，昆编复[2017]23号《昆明市机构编制委员会关于调整昆明市疾病预防控制中心机构编制有关事项的批复》文件，将昆明市健康教育所整合并入昆明市疾病预防控制中心。调整组建后，昆明市疾病预防控制中心（加挂昆明市卫生检验中心、昆明市健康教育所牌子）为昆明市卫生健康委员会管理的公益一类事业单位，机构规格正县级。

昆明市疾病预防控制中心是昆明市人民政府举办的公益事业单位，在昆明市卫生健康委员会的领导下，具体实施以下职责任务：

1.开展疾病监测，研究传染病、寄生虫病、地方病、非传染性疾病等疾病的分布，探讨疾病的发生、发展的原因和流行规律；提供制订预防控制策略与措施的技术保障；组织实施疾病预防控制工作规划、计划和方案，预防控制相关疾病的发生与流行。

2.开展突发公共卫生事件处置和救灾防病的应急准备；对突发公共卫生事件、灾后疫病进行监测报告，提供预测预警信息；开展现场调查处置和效果评估。

3.管理疾病预防控制信息系统，收集、报告、分析和评价疾病与健康危害因素等公共卫生信息，为疾病预防控制决策提供依据，为社会和公众提供信息服务。

4.开展食源性、职业性、辐射性、环境性疾病监测、调查处置和公众营养监测与评价；对生产、生活、工作、学习环境中影响人群健康的危害因素进行监测与评价，提出干预策略与措施，预防控制相关因素对人体健康的危害。

5.研究、应用实验室检测与分析技术，开展传染性疾病病原微生物的检测检验，开展中毒事件的毒物分析，开展疾病和健康危害因素的生物、物理、化学因子的检测、鉴定和评价，为突发公共卫生事件的应急处置、传染性疾病的诊断、疾病和健康相关危害因素的预防控制及卫生监督执法等提供技术支撑，为社会提供技术服务。

6.开展健康教育、健康促进；普及卫生防病知识，对公众进行健康指导；协同有关部门和组织，对公众不良健康行为进行干预，促进公众掌握自我保健与防护技能。

7.开展疾病预防控制工作业务与技术培训，提供技术指导、技术支持和技术服务；开展应用性研究，开发引进和推广应用新技术、新方法；指导和开展疾病预防控制工作绩效考核与评估。

8.完成上级交办的其他工作。

中心内设30个科室，其中业务科室20个。现有职工347人，各级各类专业技术人员309人，占职工总数89.05%。

2004年，中心被列为西部地区疾病预防控制国债建设项目和昆明市突发公共卫生事件指挥中心建设项目，新建指挥楼、疾控楼、检验楼9841.52㎡，2006年1月实施整体搬迁。中心现有工作用房建筑面积16851.5㎡，其中实验室用房6488㎡。中心目前有大型检验、监测设备共730台/套，总价值人民币7519.8万元。总固定资产1.37亿元。

目前，中心通过检验检测机构资质认定项目14类750项，通过国家实验室认可项目25类220项。

中心现拥有8项资质：实验室认可证书、检验检测机构资质认定证书、职业病诊断机构批准证书、职业健康检查机构批准证书、放射卫生技术服务资质、艾滋病中心实验室、艾滋病确证实验室、艾滋病筛查实验室。

中心始终贯彻“预防为主”的工作方针，坚持走以科研为依托，以人才为根本，以疾控为中心的道路，实行科学化、规范化、制度化管理，努力创建疾病预防控制与公共卫生技术管理与服务的新体系、新机制和工作的新局面，为保障全市人民的身体健康、提高生活质量服务，为全市的社会发展和经济建设保驾护航。