于都，是中央红军长征集结出发地，是赣南第一人口大县。苏区时期，于都县境内共有17处红军后方医院。1929年在县城天主堂成立了于都县人民诊病所，1931年在县城西儒林巷成立了于都县苏维埃红色医院。1932年2月，中国人民军队的第一所军医学校——红军军医学校在于都县城天主堂创办。1935年4月，在于都县苏维埃红色医院旧址成立了于都县临时诊所，为于都县人民医院前身。

2013年8月，国家卫计委根据《中央国家机关及有关单位对口支援赣南等原中央苏区实施方案》对口支援于都县。2014年4月，我县被列为第二批县级公立医院综合改革试点县。2014年6月，《国家卫生计生委对口支援江西省于都县振兴发展工作方案（2014-2020年）》出台。2015年1月及2019年6月我院分别被列为全面提升县级医院综合能力第一阶段、第二阶段500家县医院之一。2018年8月完成三级医院设置，为集医疗、保健、教学、科研为一体的综合性三级医院。2022年4月，整体搬迁至贡江新区。

医院占地面积263.6亩，总建筑面积20.10万平方米，床位1800张。全院共有职工总数为1340人，其中专业技术人员1209人，占职工总数的90%；高级职称128人，中级职称327人。设科室64个，县级重点学科11个，省县共建学科5个。

计算机信息化管理覆盖了医疗、服务、管理、后勤全过程，配置了轨道物流、物流机器人、5G可移动远程会诊、远程手术系统，智慧医院建设逐步升级。

医院医疗设备齐全，有3.0T磁共振成像系统、数字平板血管造影系统（DSA）、128排256层螺旋CT等多种先进设备。开展了关节镜微创手术、显微镜下脑肿瘤切除术、经DSA介入诊疗、腔镜下胃肠息肉切除等一系列先进技术，其中多项新技术、新项目达到省内县级医院先进水平，卒中中心等“五大中心”的创建取得阶段性成果。2021年DRGS综合排名位列全省三级综合医院第八位，县级医院第一位。

医院大力实施“人才兴院”战略，近几年不断选派技术人员到国内知名医院进修。在国家卫健委对口支援的大力支持下，依托对接平台，与北京大学人民医院、中山大学中山眼科中心、中南大学湘雅医院、南方医科大学南方医院、南昌大学第一附属医院等国内知名医院加强交流与合作。柔性引进高层次人才，参与医院的医疗管理、技术提升、学科发展等方面，医院核心竞争力和整体服务能力不断提升。

我院始终坚持“以病人为中心”、“病人至上”的服务理念，大力改善患者就诊环境，制定了60项便民利民措施，成立了“一站式服务”工作站，积极推进临床路径管理试点工作，大力开展“优质护理服务示范工程”和健康教育促进工作活动，形成了一套令患者满意的服务模式。

近年来我院不断加强内涵建设，在医院管理各方面得到了进一步的提升和完善，有力地促进了医院的健康、可持续发展。医院先后获得“中国县域医改·样板医院”、省级“文明单位”、“平安医院”、“健康促进医院”、“群众满意医院”、全省民主评议政风行风工作“人民群众满意的医院”、全省卫生系统“行风建设先进单位”、“全省医药卫生系统先进集体”、“江西省抗击新冠肺炎疫情先进单位”和市级“文明单位”、“先进基层党组织”、“十佳医院”、“卫生科技先进单位”、“人才工作示范点”等荣誉称号。