阿克陶县维吾尔医医院始建于1984年10月，经过38年的发展，现如今成为一家县级维吾尔医医院，2014年被国家中医药管理局评定为“二级甲等”民族医医院。医院承担着阿克陶县23余万人口的医疗保健工作任务和突发公共卫生事件的应急救援任务，承担着阿克陶县区域内的医疗、教学、康复、预防保健、培训、维吾尔药的研制等任务，是新疆维吾尔医高等学校的实习医院；负责指导阿克陶县各乡镇卫生院的中医（民族医）工作，是县级医疗保险定点单位。2021年1月，阿克陶县维吾尔医医院荣获“新疆维吾尔自治区抗击新冠肺炎疫情先进集体”称号。