五指山市中医医院创建于1984年，为原海南黎族苗族自治州中医院；1988年海南建省，自治州中医院移交通什市，隶属通什市卫生局，改名通什市中医院；2000年成立五指山市，医院更名为五指山市中医院；2012年5月15日，根据《国家中医药管理局关于规范中医医院与临床科室名称的通知》（国医药发〔2008〕12号）精神，经五指山市机构编制委员会批准，更名为“五指山市中医医院”。根据《海南省人民政府办公厅关于印发国家中医药管理局海南省人民政府促进中医药事业发展合作协议实施方案的通知》（琼府办〔2012〕22号）精神，我院要建设成为海南省中部区域中医药服务中心，服务区域涵盖五指山市以及保亭等周边市县。